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  染色质剪切与释放快速分析试剂盒(A-P-2028)
   

染色质剪切与释放快速分析试剂盒                                          货号:A-P-2028

EpiNext CUT&RUN Fast Kit

背景资料:在体内富集组蛋白或转录因子(TF)复合的DNA,然后进行下一代测序,为研究全基因组的蛋白质-DNA相互作用提供了一个有利的工具。它允许在活细胞中分析特定蛋白质与DNA序列的结合。这种分析需要该方法可靠地识别真正的目标蛋白富集区,特别是来自有限的细胞样本。这些样本可能包括从组织中分离出来的稀有细胞群,从整个细胞群中分拣出来的特定细胞,以及初级培养的亚群细胞,如胚胎细胞。此外,该方法应确保富集的DNA包含最小的背景,并确保蛋白质-DNA结合区域的映射具有最小的偏差和高分辨率。实现这一目标的一个主要方法是染色质免疫沉淀,然后进行测序(ChIP-Seq),已经使用了很长时间。然而,ChIP的主要限制是,它需要1)大量的输入材料,细胞或组织,以产生足够强的信号,超越背景噪音;和2)在初始固定步骤中的交联。有几种先进的方法可用于ChIP-Seq,减少细胞数量或提高分辨率。这些方法包括ChIP-exo和ChIPmentation。ChIP-exo提供了高分辨率的图谱,但很耗时,而且需要充足的输入细胞。虽然ChIPmentation使用转座酶和测序兼容的适配器,以便在ChIP过程中实现结扎整合,但它遵循传统的缓慢(2天)的ChIP程序,不能实现高分辨率绘图。CUT&RUN (Cleavage Under Target & Release Using Nuclease)是为了从有限的生物材料中释放捕获的目标蛋白/DNA复合物以绘制蛋白-DNA相互作用图而开发的,它明显提高了绘图分辨率。然而,CUT&RUN需要昂贵的PA/MNase融合蛋白,该蛋白具有明显的A/T序列偏差,导致目标蛋白相互作用的DNA区域图谱受到MNase消化水平的严重影响。  

该试剂盒包含从哺乳动物细胞或分离的细胞核/染色质开始成功进行CUT&RUN所需的所有必要试剂。在反应中,从细胞中分离出细胞核。用感兴趣的CHIP级抗体结合/捕获目标蛋白-DNA复合物。通过使用独特的核酸裂解酶混合物,染色质被破碎,目标蛋白/DNA复合物两端的DNA序列被裂解/移除。同时,由目标蛋白占据的DNA序列不受影响。然后目标蛋白结合的DNA被纯化和洗脱。富集的DNA可用于用各种方法分析蛋白质-DNA相互作用,特别是用下一代测序法。该试剂盒包括一个阳性对照抗体(抗H3K9me3)、一个阴性对照非免疫IgG和对照染色质,可用于证明该试剂盒的功效和在PCR/生物分析仪步骤的表现。

细胞&组织快速剪切与释放分析试剂盒是一套完整的优化试剂,从哺乳动物细胞或分离的细胞核/染色质开始成功进行CUT&RUN所需的试剂。该试剂盒旨在从低输入的细胞/染色质中快速富集特定的DNA复合物与蛋白质(组蛋白或转录因子),并通过使用Illumina平台的下一代测序或其他方法(如qPCR)鉴定或绘制体内蛋白质与DNA的相互作用。该试剂盒的创新工作原理、优化方案和组件允许捕获目标蛋白/DNA复合物,并将非特异性背景水平降到最低。捕获的DNA特别适用于构建非条形码(单倍体)和条形码(多倍体)文库,以较少的偏差和较高的分辨率绘制目标蛋白质-DNA相互作用区域。     

产品特点:

超快速可操作的步骤,仅需5小时即可完成

微孔板的设计使实验更加灵活:方便了手动或高通量

包含的柱子可以纯化DNA:节约时间和劳力

4.兼容所有以DNA为基础的扩增实验

5.简单、可信和实验条件始终如一

保存建议:在接收到艾德寄出的试剂盒后请按照说明书建议,使用不同的保存条件或温度来保存试剂盒内组分

定购信息:

产品名称 规格 操作手册 货号 询价
染色质剪切与释放快速分析试剂盒 24 次 PDF A-P-2028-24 点击这里给我发消息
染色质剪切与释放快速分析试剂盒 48 次 PDF A-P-2028-48  

表观遗传学产品全面解决方案列下:

产品名称 规格 操作手册 货号 询价
DNA羟甲基化定量试剂盒(荧光法) 48 次 PDF A-P-1037-48 点击这里给我发消息
DNA羟甲基化定量试剂盒(荧光法) 96 次 PDF A-P-1037-96  
DNA羟甲基化定量试剂盒(比色法) 48 次 PDF A-P-1036-48 点击这里给我发消息
DNA羟甲基化定量试剂盒(比色法) 96 次 PDF A-P-1036-96  
DNA甲基化定量试剂盒(荧光法) 48 次 PDF A-P-1035-48 点击这里给我发消息
DNA甲基化定量试剂盒(荧光法) 96 次 PDF A-P-1035-96  
DNA甲基化定量试剂盒(比色法) 48 次 PDF A-P-1034-48 点击这里给我发消息
DNA甲基化定量试剂盒(比色法) 96 次 PDF A-P-1034-96  
通用DNA甲基化试剂盒(定性分析) 48 次 PDF A-P-1011-48 点击这里给我发消息
通用DNA甲基化试剂盒(定性分析) 96 次 PDF A-P-1011-96  
超敏DNA甲基化定量试剂盒 48 次 PDF A-P-1021-48 点击这里给我发消息
超敏DNA甲基化定量试剂盒 96 次 PDF A-P-1021-96  
总DNA甲基化定量试剂盒 48 次 PDF A-P-1014-48 点击这里给我发消息
总DNA甲基化定量试剂盒 96 次 PDF A-P-1014-96  

推荐阅读:

关于5-hmC
5-hmC是近年来在动物组织中发现的,由胞嘧啶修饰而来。5-hmC在表观遗传学上的功能可能与5-甲基化胞嘧啶(5-mC)不同。尽管到现在为止还不确知其功能,有研究者猜测它在调控基因的表达与关闭过程中起着重要的作用。5-mC的发现让我们不得不重新评估DNA甲基信息,也不得不监测人类的健康组织和病理组织之间5-mC相对分布的差异。在EPI公司的MethylFlash技术之前,我们还没有发现任何直接的常规方法来检测5- hmC,以及区分5-hmC和5-mC

5-hmC 和 5-mC的区别
时下常用的DNA甲基化分析方法包括限制内切酶酶切和亚硫酸氢盐或MeDIP介导的MS-PCR和测序,这些技术都不适合用来检测5-hmC,因为它与5-mC事实上很难用这类方法区分开来。为了解决这个问题,EPIk研制了MethylFlash羟甲基化DNA定量试剂盒(荧光法)。本试剂盒提供了一种很经济的方法来检测5-羟甲基化胞嘧啶,并且区分5-hmC, 5-mC, 和 C,使得研究者能够重新评估他们的DNA甲基化信息,也能够在新样品中寻找DNA羟甲基化。

 
 
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